การออกแบบไพรเมอร์อย่างครอบคลุมด้วย PerlPrimer
PerlPrimer เป็นแอปพลิเคชัน GUI แบบโอเพนซอร์สฟรีที่ออกแบบมาสำหรับการออกแบบไพรเมอร์ในเทคนิค PCR ต่างๆ มันทำให้กระบวนการออกแบบไพรเมอร์ง่ายขึ้นสำหรับ PCR มาตรฐาน, bisulphite PCR, real-time PCR (QPCR), และการจัดลำดับ ทำให้เป็นเครื่องมือที่มีค่าสำหรับนักวิจัยในสาขาชีวสารสนเทศ ฟีเจอร์หลักรวมถึงการคำนวณไพรเมอร์-ไดเมอร์ที่เป็นไปได้, การดึงลำดับจีโนมจาก Ensembl, และความสามารถในการทำการค้นหา BLAST สำหรับไพรเมอร์โดยใช้เซิร์ฟเวอร์ NCBI แอปพลิเคชันยังรองรับการบันทึกผลในรูปแบบที่คั่นด้วยแท็บเพื่อการเข้าถึงที่ง่ายในแอปพลิเคชันสเปรดชีต.
โปรแกรมใช้อัลกอริธึมขั้นสูงสำหรับการตรวจจับ ORF และเกาะ CpG และอนุญาตให้ผู้ใช้เพิ่มลำดับการโคลนไปยังไพรเมอร์เพื่อให้แน่ใจว่าพวกเขายังคงอยู่ในกรอบ ด้วยการคาดการณ์อุณหภูมิการหลอมละลายที่แม่นยำตามพารามิเตอร์เทอร์โมไดนามิกที่กำหนด PerlPrimer เพิ่มโอกาสในการขยายพันธุ์ที่ประสบความสำเร็จ มันเข้ากันได้กับแพลตฟอร์มต่างๆ รวมถึง Windows, GNU/Linux, และ Mac OS X เพื่อให้แน่ใจว่ามีการเข้าถึงสำหรับผู้ใช้ที่หลากหลาย.
